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DCM파일을 nii 또는 nitif 파일로 변경시키는 방법 방법은 매우 간단하다 코드를 짤 필요도 github에서 구할 필요 없음. https://www.nitrc.org/frs/download.php/9323/win.zip/?i_agree=1&release_id=3347 들어가서 다운로드 받으세요.그리고 나머지 실행 방법은 대충 봐도 다 할 수 있음.
케라스 버젼(version) 확인 및 텐서플로우 버젼확인 코드 / Checking Keras and Tensorflow Code 텐서플로우import tensorflow as tfprint(tf.__version__) 케라스import kerasprint(keras.__version__)
DCM파일을 PNG 파일로 변환시키기 ( 더 좋은 방법) 기존에 나는 dcm이나 dcom 파일을 png 포멧으로 변환하는 파이썬 코드를 보여준 적이 있다.하지만 이것보다 더 선명하고 좋은 방법이 있다.툴을 이용하는 것... http://www.microdicom.com/downloads.html여기 들어가서 MicroDicom viewer 를 다운받는다.그리고 dcm이나 dicom 파일을 넣고나서 File 메뉴에 들어가서 Export를 한 후에 to a picture file 누르자.그 다음 filename prefix는 아예 빈 칸으로 두고 ( 뭔가 앞에 추가할 게 있으면 해라 )Image format을 jpg나 png로 바꾼다.그리고 각 설정들은 영어를 알면 다 할 수 있다. 그냥 한꺼번에 바꾸려면 create sub folder 이런거 체크 해제하자.그리..
numpy 배열 모두 출력 또는 ... 출력 / print all numpy arrays import numpy as np np.set_printoptions(threshold=np.nan) 해주면 됨. // for others import numpy as npnp.set_printoptions(threshold=np.nan) done. right?or you could set threshold option like this threshold = np.inf
우분투 boost 설치 여러 자료를 봤지만 이상하게 다 안됫따. 우선 여기를 들어오는 사람들은 분명 wget 어쩌구를 통해서 본인에게 알맞은 버전으로 다운은 받았으리라 본다. 근데 이상하게 tar xzvf를 해도 안될 것이다. 다 그렇게 했는 데 이상하게 나는 안됫다. 해결 방법 : tar xvf download 하면 댐.;;; 그리고 나머지는 http://nomorefaster.blogspot.com/2014/03/linux-boost.html 여기를 따라하면 된다.다른 문서보다 여기가 제일 정확했다. 그리고 혹시 num? 어쩌구 에러가 뜨는 사람들은 단순히 버전문제이니 너무 스트레스 받지말자.그 num 어쩌구가 없다고 뜰 텐데 그거는 16.5였나? 부터 사라진거라서 그 전꺼를 설치해야한다고 한다. 16.3을 설치하면 해결하..
Unknown runtime specified nvidia 에러 나같은 경우에는 docker-nvidia2를 깔았다. 기존 docker-nvidia를 깔은 사람들은 https://github.com/nvidia/nvidia-container-runtime#docker-engine-setup여기를 참고해서 보면 되는 데, 이상하게 여기에는 2를 깐 사람들은 저 것을 참고하면 안된다는 것이다. 2를 깔면 자동으로 되어있다 라는 식으로 말이 나온다는 거다.근데 왜 에러가 뜰까?라고 생각했지만 그냥 재시작 해보자고 했더니 됬다. sudo systemctl daemon-reload sudo systemctl restart docker 이거 치니까 해결됬음. 안해도 된다더니.... 내가 잘못 알고 있는 걸까 // for others in my case, i downloaded ..
QT_X11_NO_MITSHM not found 에러 카페를 설치하기 전에 docker를 설치하려고 하는 데, 이상하게 계속 오류가 나는 것이다.그것도 보통 QT_X11_NO_MITSHM=1 어쩌구 에러에 관한 내용은 구글에 많이 나오는 데, not found는 이상하게 거의 없다.텐서플로는 만져봤어도 카페는 처음인데, 벌써부터 이런 에러가 나서 굉장한 스트레스가 몰려왔다.우선 내꺼는 리눅스이다. 우분투 버전은 뭐 상관없는듯vi /etc/environment로 들어가면 분명 QT_X11_NO_MITSHM = 1 이라고 있는 데, 없다고 하니까 미칠 노릇. 근데 어이없게도.위에 있는 띄어쓰기를 없애주면 된다QT_X11_NO_MITSHM = 1 를QT_X11_NO_MITSHM=1이렇게 붙여주니 해결된 어이없는 경우;;; 카페 설치는 예전에 하둡을 설치할 때같은..
DCM을 PNG로 변환시키기 dcm은 pydicom이라는 거 import 시키면 됨.대체로 dcm이나 dcom 파일은 의료영상중 CT 사진 전용 파일 포멧이라고 생각하면 됨. 근데 대충 png 파일로 만드는 방법은 코드 이해하면 되고, 현재 코드에는 dcm 파일들을 읽어와서사이즈 512,512 로 되어있으니 원하는 걸로 바꾸길...그리고 이거는 png 파일 형식으로 바꾼거임.그리고 중요한 것은 이 코드 안에 normalization도 잇음. # DCM 파일을 PNG 파일로 변환 import matplotlib.pyplot as pltfrom skimage import exposure, img_as_floatimport osimport pydicom def dicom_2png(file): dcm_list = os.listdir(fil..

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